Mayapan kende zijn hoogtepunt tussen circa 1200 en 1441 na Christus. Deze stad zou volgens de Chilam Balam (Maya boeken met geschriften uit vooral de 18e en 19e eeuw maar ook geschriften uit de tijd dat de Spanjaarden in Yucatán aankwamen) in 1441 zijn verwoest.
Ooit had Mayapan ongeveer 4000 gebouwen, maar door de verwoesting is daar nu niet veel meer van over.